QMAIL3は、eml形式（一つのファイルに一つのメッセージがmessage/rfc822形式で格納された形式）と、mbox形式（一つのファイルに複数のメッセージが"From "区切りで格納された形式）のインポートとエクスポートをサポートしています。
eml形式のファイルをインポートするには、エクスプローラなどからファイルをリストビューにドラッグアンドドロップします。また、eml形式でエクスポートするには、リストビューからエクスプローラなどにメッセージをドラッグアンドドロップします。
mbox形式でインポートやエクスポートをする場合や、テンプレートを指定してエクスポートしたり、エンコーディングを指定してインポートする場合には、[ファイル]-[読み込み]や[ファイル]-[書き出し]を使用します。